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    • 特殊样本如何处理?

            脑组织属于多脂质特殊组织,建议用液氮研磨组织 ,用强力的蛋白提取液提取蛋白,防止蛋白降解(全程冰上操作,蛋白提取液要预先预冷 。不要4℃放置太长时间)。在4℃旋转混合仪上进行充分裂解30min,裂解液要充分离心4℃ ,15000rpm,30min。小心的避开脂质层,取上清再加足量或者过量的Laemmli buffer,95℃,20min加热变性,如果看不见明显的脂质层 ,可以将离心时间延长至60min。

            核蛋白和膜蛋白 ,这类蛋白的内源性表达量大部分较低,需通过专门的提取方式进行富集,然后裂解得到待测样本 ,这种类型蛋白的提取Kit商业应用已经很成熟,国内可供选择的品牌也很多。


    • 如何跑出好看的LC3双条带 ?

          根据经验,想要跑出好看的LC3双条带,最适用的条件是12%的分离胶,以及15孔的梳子进行上样和电泳 。

          依据试验 ,10孔的梳子很难分开LC3的双条带,15%的分离胶浓度可能过高,造成电泳时间变长,有条带弥散的风险。转膜使用正常的0.22μm PVDF,80v ,60min即可,转膜液添加20%甲醇 ,保证小分子蛋白与膜的结合。


    • 曝光显出多个条带 ,是杂带吗?蛋白大小跟报道的分子量不一致 ,是不是非特异带 ?

      “出现杂带”以及“条带位置不符合预期”,这两种情况需要分开讨论:

      第一种情况:蛋白转录及翻译后的修饰 ,该因素是引起杂带的最常见原因。

      转录后,由于选择性剪切的作用,同一个转录本会翻译出不同大小的蛋白,这类蛋白称为该蛋白的剪接体。

      在UniProt查询蛋白时 ,可以在“Sequences”部分看到该蛋白已报道过的Isoforms。在进行实验前,需要比对每个剪接体造成的变化是否影响了目标蛋白的对应结构域,进而判断本研究种涉及的蛋白到底应该检测哪条主带,又或者哪几条带。

      713贵宾会检测线路在阅读文献时所看到的WB实验图片中,也偶尔会出现双条带或多条带。这些现象是研究过程中值得解释和讨论的 。在进行Western Blot实验时 ,713贵宾会检测线路应该清楚,针对某些目标蛋白的检测结果并不一定是只有一条带。

      此外 ,蛋白在翻译完成后,可能会进行各类修饰,引起蛋白大小明显改变的多为糖基化修饰 。在一些分泌型蛋白和膜蛋白上 ,糖基化位点的存在会将一个蛋白的大小增加至两倍或者更多,且由于组织的特异性 ,同一个蛋白在不同样本中的糖基化修饰差别很大(如下图所示)。

      同时,有的蛋白存在前体和成熟体 ,这种蛋白一般客户在研究时 ,应该会有所了解,但为了防止信息差,依然需要跟客户解释这个蛋白本身的特性。

      曝光显出多个条带,是杂带吗;蛋白大小跟报道的分子量不一致,是不是非特异带? 

       另一种情况比较偶发:在细胞的培养状态不太好或细胞传代过多的情况下,由于基因组的变异,细胞会表达某种蛋白的截短蛋白。这种被截短、剪接后的靶蛋白可能是未经报道,但由于仍存在抗原识别位点(或抗原表位)而被识别出来。一般情况下,可以通过裁膜避免 。

       还有一各影响因素,即蛋白等电点。

       蛋白质本身是有电荷的,当处于某一个pH值时,蛋白质电荷会被中和,那么该处的数值713贵宾会检测线路称为等电点pI。大部分的蛋白质的等电点小于6,所以713贵宾会检测线路在中性的电泳环境中 ,蛋白因为等电点小于pH值,因此带负电荷,而电泳是蛋白从负极向正极迁移的过程,带负电的蛋白在电场中,不会受到阻力。但是有的蛋白等电点比较大,大于7甚至接近8,这时,由于电泳条件不足以中和电荷,使得蛋白质带正电,在电场中迁移受到阻力 ,由此产生蛋白分子量变大的错觉,因此marker仅能作为参考,而实际的主带仍然要结合蛋白特性进行判断。

       样本保存和冻融。反复的冻融 ,或者蛋白酶抑制剂 ,磷酸酶抑制剂失效,会造成蛋白质的降解,引起多条带的情况出现,但这种情况一般是以“拖尾”的形式居多。另一种情况,大分子的蛋白本身会发生降解,但是由于观测的条带在比较大的marker附近,降解的较小片段在实际裁膜过程中 ,基本检测不到 。同时,煮沸蛋白的时间不够,冻融后没有煮,会造成蛋白形成同源多聚体的形式,在目的大小两倍,或者多倍的地方出现条带。



    • 条带跑出来弥散 ,不成带型 ?

          考虑分离胶和浓缩胶的配方是否出现了问题。Tris-HCl这一类的缓冲液,APS促凝剂等等,随着配制时间 ,保存时间的推移,可能会产生pH值失衡,药物药性失效 ,导致制备凝胶时出现问题。例如 ,APS失效会引起凝胶凝固时间变长,正常条件下20分钟以内可以凝固 ,可能会延长到30到40分钟,这种情况会影响条带分离的成型 。

          客户使用380145 - Aurora B Rabbit pAb,得到如下条带:

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          经过沟通 ,更换APS之后 ,得到优化的结果 :

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          不同的缓冲体系试用pH的范围 ,一般是依据蛋白等电点等因素进行适当的选择。

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